《美台21世紀貿易倡議》先前就貿易便捷化、中小企業、反貪污、良好法規，以及服務業國內規章5大議題簽署首批協定後，台灣行政院政務委員鄧振中週三（6月21日）接受網路節目《新聞不芹菜》主持人黃光芹專訪時表示，第二階段將討論環保、勞工和農業3大議題。
綜合媒體報導，鄧振中指出，目前台灣農產和農產加工品最大外銷市場是美國，因此下一階段談判重要目標即是擴大農產品出口。他認為，第二階段談判議題比前面5項議題「困難一點」，但「不預期談不出來」，相信可繼續談下去。
另外，《美台21世紀貿易倡議》並未涉及關稅議題，遭外界質疑該協議沒有實質助益。對此，鄧振中表示，這是美國自己的國家政策，沒有任何人可以去更改，但這項倡議還是有它的價值存在，並不能完全否定掉。
據了解，《美台21世紀貿易倡議》原先包含貿易便捷、法規制定、農業、反貪污、中小企業、數位貿易、勞工、環保、標準、國營企業與非市場經濟11項議題，在兩次談判後再新增服務業國內規章總共12項。
