中國漁船翻覆2死事件延燒三週，在雙方相繼離開金門後宣告協商破局。陸方離台前受訪稱，不滿台灣方面沒人願意承擔，連一句最簡單的道歉都沒有，更說「相關後果由民進黨當局負責」。
台灣立法院內政委員會於週一（3月4日）安排「金門撞船案」專題報告，台方參加協商的人員於週日（3日）離開金門，陸方協商代表及家屬認為台方至今毫無音信，也未再返回金門，週二下午2點，搭乘小三通自水頭出發的航班返陸。
台灣海委會主委管碧玲週一在立法院內政委員會答詢表示，碰撞和撞船不同，登檢過程本身就是持續調整位置、持續碰觸的過程，碰撞是必然；她接受國會監督，但必須捍衛海巡執法立場。不過，管碧玲坦言，海巡第一時間說明的社會溝通確實不足。
海巡署長周美伍則在立法院內政委員會還原執法過程，指當時違法船舶右滿舵高速大轉彎，兩分鐘內速度由零節加速到四十節，又因平底船舶特性加上配重不良，導致右傾翻覆。
周美伍指出，執法過程中有雷達航跡及影像，至於為何不公布，則是相關資料已經交給檢調調查中。周美伍說，到底是不是陸方所說，陸艇停在那邊被台方高速撞擊，他們一直遵照檢調指示，不對外透露案情；所有雷達可看到雙方目標的航向、航速，都非常清楚，一切留給檢調說明。
針對陸方協商代表及家屬返陸，海巡署週二下午發布新聞稿回應，2月14日案發後，海巡署秉持人道精神積極協助家屬完成招魂、頭七法會等後事，並在法律規範下，盡力滿足家屬需求，以及提供具體撫慰方案，期給予最實質的協助及保障。
海巡署說，期間歷經數次協商，但陸方堅持提出不符合台方法律制度的要求，使雙方無法達成共識，台方非常遺憾，將持續保持最大誠意與開放態度，期待能早日化解歧見，共同解決問題。
